1987、1988年間，起因於發現有大量少女遭父母販賣，被推入火坑從娼，為了救援及長期協助這些不幸少女，於是在一群熱心的律師、學者及社會工作者的推動下， 1987年8月成立了「台灣婦女救援協會」。
1988年9月正式登記註冊為「財團法人台北市婦女救援基金會」（以下簡稱為婦援會），以辦理不幸婦女之救援，提供法律諮詢及服務，輔導其生活與教育，重建其自信自立之人格，助其重返家庭及社會為目的。
婦援會的成立，除了開啟台灣終止婦女買賣（trafficking women）的先驅外，更是台灣婦女運動史上結合兩性平權意識型態的倡導與實際救援行動的里程碑。為了喚起社會大眾對於婦女被迫從娼問題的重視，在1988年1月10日婦援會與婦女新知基金會、彩虹專案等團體共同發起「1988年救援雛妓大遊行」。這次的大遊行，除了為台灣社會進行一次深入的社會運動教育外，也促成媒體開始重視台灣的婦女運動，並且對於婦女運動有了正向的回應與報導。
除了以實際的行動，包含提供免費的求救電話080-239595、聯合檢警實地救援外，婦援會協助這些被迫從娼的婦女進行法律訴訟，及提供安置、就醫、就學、就業，心理輔導等多項服務。另外，為了根絕青少女被迫從娼的問題，1989年婦援會結合了立委與其它團體共同推動「少年福利法」，及1995年「兒童及少年性交易防制條例」通過實施。
1992年，婦援會設立慰安婦的申訴電話，並且在政府的委託下，對於申訴者進行調查、認證工作。至今，婦援會除了多次參加國際會議，聯合南韓、菲律賓等國向日本政府施壓，要求日本政府道歉、賠償外，並要求我國政府因先提供這些當年被日本政府強迫以身體慰勞日本軍人的我國婦女應有的各項補助與福利。
雖然雛妓救援及慰安婦問題至今仍為婦援會關心的議題，不過隨著社會的變革及婦女需求的改變，1996年婦援會在財務困難的情況下，仍堅持將婚暴婦女正式納入其服務對象，並且以法律訴訟服務、心理輔導、醫療與法院陪同、庇護轉介等多項服務協助婦女脫離婚姻暴力。
2002年，婦援會發現雖然台灣雛妓問題已不多見，但色情市場不見萎縮，大陸女子猶如十幾年前的不幸少女一般被販賣來台，因此婦援會開始了救援及關懷遭人口買賣受害者；並將實務中獲得的資訊向檢警單位提出具體建議及作法。
從台灣婦女救援協會到財團法人台北市婦女救援基金會，從以救援被迫從娼的婦女脫離控制，到關心慰安婦、提供婚暴婦女服務及救援人口買賣，婦援會見證了台灣社會的轉變，也實際參與了台灣婦女人權推動的過程。婦援會的組織變革幾乎就是一部台灣婦女權益的變遷歷史。
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